转录辅助因子对不同类型的核心启动子不具特异性

2021-12-06 08:19:18 来源:

激活辅助抗原（transcriptional cofactor， COF）在增强子与基因序列表达密切关系传递调控线索，是激活激活和基因序列表达的两大效应物。虽然已表明某些COF比其他COF更偏好某些基因序列表达型式，但是多种不同COF对多种不同基因序列表达辨识显露的内在抗原的程度尚不正确。在一项新的深入研究中，来自匈牙利维也纳生物中心大分子病理学深入研究所的深入研究部门在黑腹豚鼠S2蛋白中使用高通量基因序列表达活性测出来选取23个COF激活7.2万个候选两大基因序列表达（core promoter， CP）的能力。相关深入研究结果于2019年5月15日在线登载在Nature医学期刊上，论文标题为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些深入研究部门观察到两大基因序列表达的差异激活，这表明COF与特定型式的两大基因序列表达密切关系存在着多种不同的抑制偏好或者说“实用性（compatibilities）”。这些功用多种不同的两大基因序列表达在TATA纸制、沿河基因序列表达模组（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等仅有的序列模组上差异性地石英砂，并在内源性位点上辨识显露多种不同的染色质特性。值得注意的是，这些两大基因序列表达型式在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上存在多种不同的相对丰度，这表明这些鸟嘌呤修饰可能尽可能区分官能团抑制抗原而不是基因序列表达和增强子型式的顺式抑制模组。这些深入研究部门表明在人蛋白和另外两种豚鼠蛋白中表明了多种不同COF-两大基因序列表达实用性的存在。为此，他们发现了分别偏好TATA纸制和CpG岛基因序列表达的COF。COF和两大基因序列表达密切关系的多种不同实用性尽可能解释多种不同的增强子如何抗原地激活多种不同组的基因序列、相同基因序列内的可控基因序列表达（alternative promoter）和相同基因序列表达内的多种不同激活起始位点。综上所述，COF-两大基因序列表达实用性可能是豚鼠和人类等多种不同物种中多种不同激活程序的典范。原始显露处：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]